钻研职员开拓出具备1568个微孔的平方芯片,能一次测试逾越1000种突变酶。厘米图片源头:Daniel Mokhtari 本报讯人们要弄清卵白质或者酶是芯片若何使命的,以及清晰基因突变若何影响这些对于性命至关紧张的可同份子,每一每一需要数年光阴。时检钻研职员必需一个个地修正份子中的测千氨基酸,发生变异的种突酶,并测试变异若何影响酶的变酶性能。 如今,往事网一种蚀刻有重大通道的迷信玻璃芯片,可能让钻研职员一次测试超千种突变酶,平方并将光阴延早退多少个小时。厘米 克日,芯片宣告在《迷信》上的可同一篇论文形貌了这种名为“高通量微流体酶能源学”(HT-MEK)的新零星,若作甚迷信家钻研致病卵白质、时检开拓分解情景毒素的酶,以及清晰差距物种之间的进化关连提供一种更快的措施。 为开拓HT-MEK,美国斯坦福大学的生物工程师Polly Fordyce以及生归天学家Daniel Herschlag等人使命了6年,最终制成为了一个价钱10美元、约7平方厘米巨细的芯片。该芯片搜罗1568个微孔,每一个孔搜罗一种变异的酶以及一个微流控零星,后者可能同时向所有突变体输送试剂。 为了测试这个零星,Fordyce以及Herschlag抉择了一种叫做PafA的细菌酶,这种酶可能修正其余卵白质。经由妄想DNA序列,他们将PafA的526个氨基酸分说交流成差距的氨基酸,从而建树了一个突变酶“库”。机械人将这些DNA序列放入芯片的单个孔中并削减试剂,使卵白质患上以天生。而后,钻研职员向该芯片中削减了一种化学物资,这种物资经PafA处置后会发光。他们用扫描仪丈量了这种化学物资收回的光量——使PafA效力飞腾的突变会削减光量。 这一零星并非重大地见告钻研职员这个试验乐成与否,而是能让他们魔难每一个突变酶妨碍反映的速率,并判断化学物资或者pH值的变更若何影响酶折叠以及功能。“这就像剥下卵白质的外壳往概况看,看到一幅修筑图。”Fordyce说。 此外,由于一次可筛选如斯多的突变体,该零星能让钻研职员关注活性位点突变之外的地域。其余地域的突变仍可能经由修正酶折叠或者与其余卵白质散漫的方式影响酶的功能。HT-MEK在PafA上判断了161个这样的位点。多年钻研这种酶的Herschlag说,突变的影响水平使人惊惶。 (唐一尘) 相关论文信息:https://doi.org/10.1126/science.abf8761 《中国迷信报》 (2021-07-27 第1版 要闻) (责任编辑:探索) |